После объявления большевиками красного террора в 1918 году, по всей стране, начиная со столиц, прокатилась волна жестоких репрессий. 23 августа (5 сентября) 1918 г. епископ Селенгинский Ефрем (Кузнецов), протоиерей Иоанн Восторгов и ещё несколько узников, среди которых находились и члены царского правительства, были расстреляны в Петровском парке, недалеко от мемориального кладбища на Соколе.
Смерть за Христа владыка Ефрем принял спокойно. Перед расстрелом благословил соузников, вместе с ним приведенных на казнь.
Очевидцы рассказывали: «По просьбе отца Иоанна палачи разрешили всем осужденным помолиться и попрощаться друг с другом. Все встали на колени, и полилась горячая молитва… А затем все простились друг с другом. Первым подошел к могиле протоиерей Иоанн Восторгов, сказавший перед тем несколько слов остальным, приглашая всех с верою в милосердие Божие и скорое возрождение Родины принести последнюю искупительную жертву. “Я готов”, – заключил он, обращаясь к конвою. Все встали на указанные места. Палач подошел к нему со спины вплотную, взял его левую руку, вывернул за поясницу и, приставив к затылку револьвер, выстрелил, одновременно толкнув отца Иоанна в могилу».
